Index

A

a_idx (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) act (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron attribute) act_dict (in module lasdi.networks)

act_type (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron attribute) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron attribute) ae_loss (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) appendTrainSpace() (lasdi.param.ParameterSpace method) Autoencoder (class in lasdi.latent_space) autoencoder (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) average_rom() (in module lasdi.gplasdi)

B

Backward (lasdi.latent_space.CNN2D.Mode attribute) (lasdi.networks.CNN2D.Mode attribute) batch_reshape (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) BayesianGLaSDI (class in lasdi.gplasdi)

best_coefs (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) best_loss (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) bias (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) Burgers1D (class in lasdi.physics.burgers1d)

C

calibrate() (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics method) (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy method) calls (lasdi.timing.Timer attribute) channels (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) CNN2D (class in lasdi.latent_space) (class in lasdi.networks) CNN2D.Mode (class in lasdi.latent_space) (class in lasdi.networks) coef_loss (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) coef_norm_order (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy attribute) coef_weight (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) coefs (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics attribute) collect_samples() (in module lasdi.workflow) CollectSample (lasdi.enums.NextStep attribute) Complete (lasdi.enums.Result attribute) compute_errors() (in module lasdi.postprocess)

compute_input_layer_size() (lasdi.latent_space.CNN2D class method) (lasdi.networks.CNN2D class method) compute_kernel_size() (lasdi.latent_space.CNN2D class method) (lasdi.networks.CNN2D class method) compute_output_layer_size() (lasdi.latent_space.CNN2D class method) (lasdi.networks.CNN2D class method) compute_time_derivative() (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy method) Conv2DAutoencoder (class in lasdi.latent_space) convergence_threshold (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) convert() (lasdi.fd.Stencil method) create_uniform_1dspace() (in module lasdi.param) createHyperGridSpace() (lasdi.param.ParameterSpace method) createHyperMeshGrid() (lasdi.param.ParameterSpace method) createInitialTrainSpace() (lasdi.param.ParameterSpace method) createInitialTrainSpaceForHull() (lasdi.param.ParameterSpace method) createTestGridSpace() (lasdi.param.ParameterSpace method) createTestGridSpaceForHull() (lasdi.param.ParameterSpace method) createTestHullSpace() (lasdi.param.ParameterSpace method)

D

data_shape (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) decoder (lasdi.latent_space.Autoencoder attribute) (lasdi.latent_space.Conv2DAutoencoder attribute) dict_ (lasdi.inputs.InputParser attribute) dilations (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute)

dim (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics attribute) (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute) dt (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute) dx (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute)

E

encoder (lasdi.latent_space.Autoencoder attribute) (lasdi.latent_space.Conv2DAutoencoder attribute) end() (lasdi.timing.Timer method) eval_gp() (in module lasdi.gp) export() (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI method) (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics method) (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy method) (lasdi.latent_space.Autoencoder method) (lasdi.latent_space.Conv2DAutoencoder method) (lasdi.latent_space.LatentSpace method) (lasdi.param.ParameterSpace method) (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D method) (lasdi.physics.OfflineFOM method) (lasdi.physics.Physics method) (lasdi.timing.Timer method)

F

Fail (lasdi.enums.Result attribute) fcs (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron attribute) fd (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy attribute) fd_oper (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy attribute) fd_type (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy attribute) FDdict (in module lasdi.fd)

fit_gps() (in module lasdi.gp) Forward (lasdi.latent_space.CNN2D.Mode attribute) (lasdi.networks.CNN2D.Mode attribute) forward() (lasdi.latent_space.Autoencoder method) (lasdi.latent_space.CNN2D method) (lasdi.latent_space.Conv2DAutoencoder method) (lasdi.latent_space.LatentSpace method) (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron method) (lasdi.networks.CNN2D method) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron method)

G

generate_solutions() (lasdi.physics.OfflineFOM method) (lasdi.physics.Physics method) get_1dspace_from_list() (in module lasdi.param) get_fom_max_std() (in module lasdi.gplasdi) get_new_sample_point() (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI method) getDictFromList() (in module lasdi.inputs) getInput() (lasdi.inputs.InputParser method)

getOperators() (lasdi.fd.Stencil method) getParam1DSpace (in module lasdi.param) getParameter() (lasdi.param.ParameterSpace method) grid_size (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute) groups (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute)

H

heatmap2d() (in module lasdi.postprocess)

I

init_weight() (lasdi.latent_space.CNN2D method) (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron method) (lasdi.networks.CNN2D method) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron method) initial_condition() (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D method) (lasdi.physics.Physics method) initial_condition_latent() (in module lasdi.latent_space) initialize_latent_space() (in module lasdi.workflow) initialize_physics() (in module lasdi.workflow) initialize_trainer() (in module lasdi.workflow)

InputParser (class in lasdi.inputs) interiorIndexes (lasdi.fd.SBP12 attribute) (lasdi.fd.SBP24 attribute) (lasdi.fd.SBP36 attribute) (lasdi.fd.SBP48 attribute) (lasdi.fd.Stencil attribute) interiorStencils (lasdi.fd.SBP12 attribute) (lasdi.fd.SBP24 attribute) (lasdi.fd.SBP36 attribute) (lasdi.fd.SBP48 attribute) (lasdi.fd.Stencil attribute)

J

jacobian() (in module lasdi.physics.burgers1d)

K

kernel_sizes (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute)

L

lasdi module lasdi.enums module lasdi.fd module lasdi.gp module lasdi.gplasdi module lasdi.inputs module lasdi.latent_dynamics module lasdi.latent_dynamics.sindy module lasdi.latent_space module lasdi.networks module lasdi.param module lasdi.physics module lasdi.physics.burgers1d module lasdi.postprocess module lasdi.timing module lasdi.workflow module latent_dict (in module lasdi.workflow) latent_dynamics (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) LatentDynamics (class in lasdi.latent_dynamics)

LatentSpace (class in lasdi.latent_space) layer_sizes (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron attribute) ld_dict (in module lasdi.workflow) ld_loss (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) ld_weight (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) leftBdrDepth (lasdi.fd.SBP12 attribute) (lasdi.fd.SBP24 attribute) (lasdi.fd.SBP36 attribute) (lasdi.fd.SBP48 attribute) (lasdi.fd.Stencil attribute) leftBdrNorm (lasdi.fd.SBP12 attribute) (lasdi.fd.SBP24 attribute) (lasdi.fd.SBP36 attribute) (lasdi.fd.SBP48 attribute) (lasdi.fd.Stencil attribute) leftBdrStencils (lasdi.fd.SBP12 attribute) (lasdi.fd.SBP24 attribute) (lasdi.fd.SBP36 attribute) (lasdi.fd.SBP48 attribute) (lasdi.fd.Stencil attribute) leftBdrWidth (lasdi.fd.SBP12 attribute) (lasdi.fd.SBP24 attribute) (lasdi.fd.SBP36 attribute) (lasdi.fd.SBP48 attribute) (lasdi.fd.Stencil attribute) load() (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI method) (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics method) (lasdi.latent_space.Autoencoder method) (lasdi.latent_space.Conv2DAutoencoder method) (lasdi.latent_space.LatentSpace method) (lasdi.param.ParameterSpace method) (lasdi.timing.Timer method) lr (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute)

M

main() (in module lasdi.physics.burgers1d) (in module lasdi.workflow) max_greedy_iter (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) max_iter (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) maxk (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) module lasdi lasdi.enums lasdi.fd lasdi.gp lasdi.gplasdi lasdi.inputs lasdi.latent_dynamics lasdi.latent_dynamics.sindy lasdi.latent_space lasdi.networks lasdi.param lasdi.physics lasdi.physics.burgers1d lasdi.postprocess lasdi.timing lasdi.workflow

MSE (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy attribute) MultiLayerPerceptron (class in lasdi.latent_space) (class in lasdi.networks)

N

n_init (lasdi.param.ParameterSpace attribute) n_iter (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) n_layers (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron attribute) n_param (lasdi.param.ParameterSpace attribute) n_samples (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) n_test() (lasdi.param.ParameterSpace method) n_train() (lasdi.param.ParameterSpace method)

n_z (lasdi.latent_space.LatentSpace attribute) name (lasdi.inputs.InputParser attribute) names (lasdi.timing.Timer attribute) ncoefs (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics attribute) (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy attribute) NextStep (class in lasdi.enums) nt (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics attribute) (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute)

O

offline (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute)

OfflineFOM (class in lasdi.physics) optimizer (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) optimizer_to() (in module lasdi.gplasdi)

P

padding_mode (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) paddings (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) param_list (lasdi.param.ParameterSpace attribute) param_name (lasdi.param.ParameterSpace attribute) (lasdi.physics.Physics attribute) param_space (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) ParameterSpace (class in lasdi.param) parser (in module lasdi.workflow) path_checkpoint (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) path_results (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute)

Physics (class in lasdi.physics) physics (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) physics_dict (in module lasdi.workflow) pick_samples() (in module lasdi.workflow) PickSample (lasdi.enums.NextStep attribute) plot_gp2d() (in module lasdi.postprocess) plot_prediction() (in module lasdi.postprocess) print() (lasdi.timing.Timer method) print_architecture() (lasdi.latent_space.Conv2DAutoencoder method) (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron method) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron method) print_data_shape() (lasdi.latent_space.CNN2D method) (lasdi.networks.CNN2D method)

Q

qdim (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute)

qgrid_size (lasdi.latent_space.LatentSpace attribute) (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute)

R

reshape_index (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron attribute) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron attribute) reshape_shape (lasdi.latent_space.MultiLayerPerceptron attribute) (lasdi.networks.MultiLayerPerceptron attribute) residual() (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D method) (lasdi.physics.Physics method)

residual_burgers() (in module lasdi.physics.burgers1d) restart_iter (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) Result (class in lasdi.enums) run_samples() (in module lasdi.workflow) RunSample (lasdi.enums.NextStep attribute)

S

sample() (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics method) sample_coefs() (in module lasdi.gp) sample_roms() (in module lasdi.gplasdi) SBP12 (class in lasdi.fd) SBP24 (class in lasdi.fd) SBP36 (class in lasdi.fd) SBP48 (class in lasdi.fd) set_batch_shape() (lasdi.latent_space.Conv2DAutoencoder method) set_data_shape() (lasdi.latent_space.CNN2D method) (lasdi.networks.CNN2D method) simulate() (lasdi.latent_dynamics.LatentDynamics method) (lasdi.latent_dynamics.sindy.SINDy method)

SINDy (class in lasdi.latent_dynamics.sindy) solve() (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D method) (lasdi.physics.Physics method) solver() (in module lasdi.physics.burgers1d) space_dim (lasdi.latent_space.Autoencoder attribute) start() (lasdi.timing.Timer method) starts (lasdi.timing.Timer attribute) Stencil (class in lasdi.fd) step() (in module lasdi.workflow) strides (lasdi.latent_space.CNN2D attribute) (lasdi.networks.CNN2D attribute) Success (lasdi.enums.Result attribute)

T

t_grid (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute) test_grid_sizes (lasdi.param.ParameterSpace attribute) test_meshgrid (lasdi.param.ParameterSpace attribute) test_space (lasdi.param.ParameterSpace attribute) Timer (class in lasdi.timing)

timer (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) times (lasdi.timing.Timer attribute) tmax (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) Train (lasdi.enums.NextStep attribute) train() (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI method) train_space (lasdi.param.ParameterSpace attribute) trainer_dict (in module lasdi.workflow) training_loss (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute)

U

Unexecuted (lasdi.enums.Result attribute)

V

verbose (in module lasdi.inputs)

W

w_idx (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute)

X

x_grid (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) (lasdi.physics.OfflineFOM attribute) (lasdi.physics.Physics attribute)

X_test (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) X_train (lasdi.gplasdi.BayesianGLaSDI attribute) xmax (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute) xmin (lasdi.physics.burgers1d.Burgers1D attribute)